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发布日期:2024-07-12 05:32    点击次数:152

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  鹰嘴豆是天下第三大豆类作物kaiyun官方网站。(CFP供图)

  【深圳商报讯】(首席记者袁静娴)鹰嘴豆是天下第三大豆类作物,被杰出50个国度训诫和食用,具有遑急的经济价值和养分价值;同期,鹰嘴豆的固氮才智还能改善泥土肥力,具有特有的生态价值。然则,由于历史上的进化瓶颈,导致鹰嘴豆的遗传布景相对局促、相背生物或非生物要挟的才智不及,闭幕了它的育种鼎新。

  为助力照应这一艰辛,近日,华大生命科学探讨院齐集国外半干旱热带作物探讨中心、西澳大学、莫说念克大学等单元,告捷拼装了8个一年生鹰嘴豆属野生种(以下简称“野生种”)的基因组,并结合已发表的2个鹰嘴豆基因组,构建了超等泛基因组,为鹰嘴豆育种提供了遑急数据资源和所在。收尾发表于《当然·遗传学》(Nature Genetics)。

  探讨拼装的8个高质地野生种基因组,大小从435Mb到895Mb不等、基因数从23486到29642不等。通过基因组共线性和系统发育分析,发现可能存在迂腐的重排事件。探讨还发现鹰嘴豆属具有3个遑急的基因池,并估计了基因池之间的不合时候。

  探讨格式得当东说念主、澳大利亚莫说念克大学国度农业生物时间中心主任拉吉夫·瓦尔什尼(Rajeev Varshney)素质默示:“在这项新探讨中,鹰嘴豆现有近缘野生种的基因组和特有基因资源,将极大鼓吹鹰嘴豆育种鸿沟在澳大利亚乃至寰球的逾越。”

  探讨揭示,鹰嘴豆属超等泛基因组由24827个基因家眷构成。其中,14748个基因家眷为中枢基因,它们存在于鹰嘴豆属的悉数物种,主要参与滋长、DNA建树、细胞通讯等基本生物功能;6212个基因家眷为可变基因,它们存在于鹰嘴豆属的2-8个物种中,主要参与堤防反馈、滋长素反馈、生物刺激反馈等生物功能。

  此外,探讨团队通过将闭塞出的结构变异整合到参考基因组中,进而挖掘了477个鹰嘴豆属个体中的变异各样性。

  收尾发现,这些变异在着花时候和抗病性等遑急性状中可能饰演着遑急扮装。

  论文第一作家、国外半干旱热带作物探讨中心高等科学家阿米尔·汗(Aamir W. Khan)合计:“不单是局限于物种内各样性的挖掘,本探讨将野生近缘种这一相配遑急的资源纳入,不错在更平素的基因各样性基础上,挖掘农艺学性状相干的遑急基因,有望鼓吹鹰嘴豆品种的进一步遗传育种鼎新。”

  从2013年构建首个鹰嘴豆参考基因组驱动,拉吉夫·瓦尔什尼团队就握续与华大结合开展相干探讨,并抑制深切。关于这次探讨,他默示:“很欣喜与华大过甚他结合者共同开展鹰嘴豆属超等泛基因组。咱们的探讨发现,近缘野生种具有更多的遗传各样性和变异,可能有助于改善鹰嘴豆的抗病性、着花时候和抗逆性等性状。”

  著述通讯作家、华大生命科学探讨院刘心探讨员默示kaiyun官方网站,一系列基因组学探讨将鼓吹鹰嘴豆的育种鼎新,同期为其他作物的鼎新、吩咐风景变化和食粮安全照应提供决议。